市直各委、办、局，分管发改委、财政局、应急局、国资委、统计局、金融监管局、审批管理局、大数据局，市委改革办、审计办、军民融合办，国网厦门供电公司，分管交通局、商务局（口岸办）、退役军人局（双拥办）、厦门港口局，民航厦门安全监管局、民航厦门空中交管站、邮政管理局、东海救助局厦门基地、东海第二救助飞行队，厦门航空公司，分管资源规划局、建设局、市政园林局、执法局、住房局，联系市委文明办，分管公安局、司法局、国动办（人防办）、信访局，联系市委政法委、依法治市办、网信办、机要保密局，厦门大学、华侨大学（厦门校区）、集美大学、理工学院、医学院等高校，分管科技局、工信局、文旅局、外办、金砖办、会展局，厦门自贸片区管委会，气象局、水文局、海洋三所、厦门海洋中心。